10 × Genomics Flex 유전자 발현 프로토콜은 고정 또는 냉동 물질을 프로파일링하는 프로브 기반 방법으로, scRNA-seq 전 샘플 처리 과정을 간소화합니다. 프로브는 인간 및 마우스에만 존재하지만, 우리는 혼합된 인간-마우스 세포를 포함한 이식 샘플을 단일 반응에서 두 프로브 세트를 결합하여 프로파일링할 수 있음을 보여줍니다. Cellranger는 특정 프로브가 교차 반응성을 가진 프로브보다 강력하게 성능을 발휘하는 종 특이적인 카운트 테이블을 생성합니다. 우리는 교차 반응 신호를 제거하는 방법을 구현하여 깨끗한 종 특이적인 행렬을 도출합니다. 이 솔루션은 흐름 분주 없이 이식체의 scRNA-seq을 가능하게 하고, 이식과 그 미세 환경의 분석을 지원합니다.
Llorà-Batlle et al. (Fri,)은 이 질문을 연구했습니다.