g:Profiler—um servidor web para interpretação funcional de listas de genes (atualização de 2016)

A análise de enriquecimento funcional é uma etapa fundamental na interpretação de listas de genes descobertas em diversos experimentos de alto rendimento. O g:Profiler estuda listas de genes planas e classificadas e encontra termos de Gene Ontology, vias e outros termos relacionados à função gênica que são estatisticamente significativos. A tradução de centenas de identificadores de genes é outra característica central do g:Profiler. Desde sua primeira publicação em 2007, nosso servidor web se tornou uma ferramenta popular entre pesquisadores básicos e translacionais. A pontualidade é uma grande vantagem do g:Profiler, pois as informações do genoma e das vias são sincronizadas com o banco de dados Ensembl em atualizações trimestrais. O g:Profiler suporta 213 espécies, incluindo mamíferos e outros vertebrados, plantas, insetos e fungos. A atualização de 2016 do g:Profiler introduz várias novas funcionalidades. Adicionamos mais conjuntos de dados funcionais para interpretar listas de genes, incluindo previsões de locais de ligação de fatores de transcrição, anotações de doenças mendelianas, informações sobre expressão de proteínas e complexos e mapeamentos de polimorfismos genéticos humanos. Além da interface web interativa, o g:Profiler pode ser acessado em pipelines computacionais usando nosso pacote R, interface Python e componente BioJS. O g:Profiler está disponível gratuitamente em http://biit.cs.ut.ee/gprofiler/.