SIRIUS: decompondo padrões isotópicos para identificação de metabólitos

Motivação do Resumo: A espectrometria de massas de alta resolução (MS) está entre as tecnologias mais amplamente utilizadas em metabolômica. Os metabólitos participam de quase todos os processos celulares, mas a maioria dos metabólitos ainda permanece não caracterizada. A determinação da fórmula somatória é um passo crucial na identificação de um metabólito desconhecido, pois reduz suas possíveis estruturas a um conjunto que, espera-se, seja gerenciável. Resultados: Apresentamos um método para determinar a fórmula somatória de um metabólito apenas a partir de sua massa e da distribuição natural de seus isótopos. Nossa entrada é um padrão isotópico medido de um espectrômetro de massas de alta resolução, e queremos encontrar as moléculas que melhor correspondem a esse padrão. Nosso método é computacionalmente eficiente, e os resultados em dados experimentais são muito promissores: para espectrometria de massas de tempo de voo ortogonal, identificamos corretamente fórmulas somatórias para 90% das moléculas, variando em massa até 1000 Da. Disponibilidade: SIRIUS está disponível sob a licença LGPL em http://bio.informatik.uni-jena.de/sirius/ Contato: anton.pervukhin@minet.uni-jena.de Informações suplementares: Dados suplementares estão disponíveis no Bioinformatics online.