Identifica uma nova superfamília de helicases putativas com segmentos conservados envolvidos na replicação, recombinação, reparo e expressão de genomas de DNA e RNA.
No curso da análise sistemática de sequências de proteínas contendo o motivo de ligação de NTP de purina, uma nova superfamília foi delineada, incluindo 25 helicases estabelecidas ou putativas de Escherichia coli, levedura, insetos, mamíferos, pox- e herpesvírus, um plasmídeo mitocondrial de levedura e três grupos de vírus de RNA de fita positiva. Essas proteínas continham 7 segmentos conservados distintos altamente conservados, dos quais dois correspondiam aos locais "A" e "B" do motivo de ligação de NTP. Típico da nova superfamília era um consenso abreviado para o local "A", GxGKS/T, em vez do clássico G/AxxxxGKS/T. Previsões de estrutura secundária indicaram que cada um dos segmentos conservados poderia constituir uma unidade estrutural separada centrada em um beta-turn. Todas as mutações previamente caracterizadas que comprometem a função da helicase RAD3 de levedura no reparo de DNA mapeavam para um dos segmentos conservados. Um grau de semelhança foi revelado entre o padrão de consenso de resíduos de aminoácidos conservados derivados da nova superfamília e o de outra superfamília de proteínas recentemente descrita, incluindo um conjunto diferente de helicases procarióticas, eucarióticas e virais (putativas).
Gorbalenya et al. (Sun,) estudaram essa questão.
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