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Resumo: Desenvolvemos um modelo computacional que prevê a probabilidade de ligação de fatores de transcrição a qualquer local no genoma. O GOMER (modelo de ocupação generalizável da regulação da expressão) calcula as probabilidades de ligação com base em matrizes de peso de posição e incorpora os efeitos de cooperatividade e competição por meio do cálculo explícito de equilíbrios de ligação acoplados. O GOMER pode ser usado para testar hipóteses sobre a regulação gênica que se baseiam nessa previsão fisicamente fundamentada da ligação proteína-DNA.
Granek et al. (Sex,) estudaram esta questão.
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