摘要 引言 药物耐药是癌症治疗长期有效性的主要障碍。大约70%的乳腺癌患者在治疗5年后复发，而与药物耐药相关的生物标志物的缺乏在临床上导致预后不良。先前的研究利用组学方法揭示推动药物耐药的生物标志物，重点强调遗传突变。 方法 在这里，我们通过采用综合多组学策略，结合ATAC-seq、RNA-seq和蛋白组学，鉴定出与HER2阳性乳腺癌模型中拉帕替尼耐药相关的九个标志物签名。 结果 我们发现，这个药物耐药签名中的七个标志物以前没有被发现与HER2阳性乳腺癌有关，其中一些在额外的肺癌模型中进行了进一步验证。我们反直觉地发现，耐药细胞具有限制的染色质可及性，基因表达减少，且总蛋白组变化有限。然而，仔细观察后，我们发现耐药签名在这七个标志物的转录起始位点附近染色质可及性增加，并且在三个数据集中表达差异显著。我们的数据表明，尽管整体转录和蛋白质组景观显示变化有限，但有几个标志物表达高，且与拉帕替尼耐药细胞相比，体外增加了锚定独立和侵袭性表型。 结论 我们的结果表明，疾病的侵袭性与染色质和基因表达动态的减少有关。我们预计这里通过综合目标发现方法识别的耐药签名可以应用于更复杂的、更具代表性的模型中并进行验证，然后可以通过合适的治疗剂进行靶向。
Steggall等（周六）研究了这个问题。