结直肠癌患者的基因组特征分析

遗传性结直肠癌（CRC）易感综合征占所有确诊CRC病例的5-10%。Lynch syndrome（LS）、家族性腺瘤性息肉病（FAP）和MUTYH-associated polyposis（MAP）是已明确具有结直肠癌易感性的遗传综合征。然而，除了这些已确立的疾病之外，其他遗传性基因因素仍未得到充分探索。近年来，二代测序（NGS）技术的进步促进了对癌症易感基因中胚系致病变异（gPV）的识别，从而改善了遗传性CRC综合征的诊断和管理策略。本研究利用该技术，旨在探讨来自23个不同家族的23例土耳其患者的CRC遗传病因。从2019年至2022年间接受检查的54例个体队列中，筛选出具有结直肠癌（CRC）或息肉病个人史或家族史的患者。在Illumina NextSeq二代测序（NGS）平台上使用TruSight® Cancer和Qiaseq panels进行基因检测。共鉴定出23个变异，包括10个致病或可能致病变异，其中5个为新发现变异。这些胚系致病/可能致病变异检出于与LS和FAP相关的关键基因MLH1、MSH6、PMS2和APC中。在其他基因（包括FANCC、CHEK2、ATM和MUC16）中也发现了变异。此外，共鉴定出13个意义未明变异（VUS），其中5个为新发现变异。这些VUS检出于MUTYH（与MAP相关）、ATR、XRCC3、PALB2、ATM、SYNE1、RAD51D、NF1、ABRAXAS1、ERBB2、FGFR和CHEK2基因中，需要进一步研究以明确它们在CRC易感性中的潜在作用。这些发现突显了NGS在识别与遗传性CRC综合征相关的胚系变异中的实用价值，并强调了开展功能研究以评估VUS致病性的必要性。