囊虫病毒和部分湖西奈病毒变种主导了表现出欧洲坏脾气症状的蜜蜂（Apis mellifera）群体

摘要 欧洲坏脾气（EFB）是美国欧洲蜜蜂（Apis mellifera）中一种流行的疾病，可能导致群体衰退和崩溃。EFB的细菌成分已有很多研究，但感染群体中病毒感染的多样性尚未被探讨。在本研究中，我们利用对12个蜜蜂蜂箱进行的元转录组测序，这些蜂箱表现出EFB症状（+，n = 6）和无症状（–，n = 6），来调查与该疾病相关的病毒感染。我们组装了41个病毒基因组，属于三大家族（Iflaviridae，Dicistroviridae和Sinhaliviridae），这些病毒在蜜蜂中均已被报道，包括湖西奈病毒、变形翅膀病毒、囊虫病毒、黑蜂王细胞病毒和以色列急性麻痹病毒。在严重的EFB群体中，我们观察到病毒基因组的发生频率更高（34个基因组），而健康群体中得到的基因组更少（七个基因组），且完全没有Dicistroviridae基因组。我们观察到特定的湖西奈病毒谱系仅与EFB+或EFB–群体相关，此外，EFB受灾的群体中囊虫病毒的相对丰度增加。多变量分析强调，地点和EFB疾病状态的组合影响RNA病毒组的组成，而单独的EFB状态并没有显著影响，从而给不同养蜂场间的比较带来挑战。这些发现有助于理解受到EFB影响的蜜蜂群体中的病毒动态，并强调未来的研究在调查EFB时需要考虑病毒组成的重要性。重要性 本研究关于受欧洲坏脾气（EFB）影响的蜜蜂群体的病毒组揭示了在流行的细菌繁殖疾病背景下蜜蜂群体中的病毒种群动态。与严重EFB受影响的群体相关的不同湖西奈病毒和囊虫病毒谱系的识别，暗示了病毒组成和疾病状态之间的潜在联系，强调了进一步调查病毒在EFB感染中的作用的必要性。在EFB感染期间观察到的囊虫病毒增加暗示了一种潜在的病毒失调，可能对蜜蜂幼虫健康产生影响。这些发现为养蜜蜂实践提供了有价值的见解，为未来的研究奠定了基础，旨在理解和减轻细菌和病毒感染在商业蜜蜂作业及EFB管理中的影响。