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脓毒症是一种由感染引发的危及生命的综合征,伴有高死亡率,抗微生物耐药(AMR)进一步加剧了临床挑战。迅速而可靠地检测致病原和抗微生物耐药是迅速和适当治疗的关键因素,以改善脓毒症患者的预后。然而,当前基于血培养的脓毒症诊断在敏感性和特异性上受到限制,而目前的分子方法未能进入临床常规。因此,我们开发了一种基于抑制PCR的选择性富集测序方法(SUPSETS),提供一种分子方法,将多重抑制PCR与纳米孔测序结合起来,使用等离子体细胞游离DNA识别最常见的脓毒症致病原和抗微生物耐药。在一项概念验证研究中,仅用1 mL等离子体,我们针对三界中的八种病原体和十种抗微生物耐药。SUPSETS成功在前十个临床样本上测试,结果与临床宏基因组学相当,同时明显优于血培养。还检测到几种临床相关的抗微生物耐药。此外,SUPSETS在开始测序后的几分钟内提供了首批病原体和特定耐药性的测序读数,从而可能将结果时间减少到11 - 13小时,显示出脓毒症中的诊断潜力.
Sonntag等人(Mon,)研究了这个问题。