在软组织和子宫平滑肌肉瘤中开发新的基因组风险分层模型

摘要 目的：平滑肌肉瘤（LMS）是一类临床和分子异质性肿瘤。尽管近期进行了大规模的基因组研究，但当前LMS的风险分层并未考虑分子变异。我们提出一个临床适用的基因组风险分层模型。实验设计：我们对195例软组织LMS（STLMS）进行全面的基因组剖析，其中151例为初次表现，238例子宫LMS（ULMS）作为对照组，177例为初次表现，随访至少1年。结果：在STLMS中，法国癌症中心联合会（FNCLCC）分级，但不是肿瘤大小，能够预测无进展生存期（PFS）或疾病特异性生存期（DSS）。相反，在ULMS中，肿瘤大小、有丝分裂指数和坏死与较差的PFS和DSS相关。在STLMS中，3级基因组风险分层在DSS中的表现良好：高风险：RB1突变和chr12q缺失（del12q）/ATRX突变的共存；中风险：RB1突变、ATRX突变或del12q的存在；低风险：缺乏这三种变异中的任何一种。RB1和ATRX变异在分层STLMS的能力在外部AACR GENIE队列中得到了验证。在ULMS中，3级基因组风险分层对PFS和DSS均有显著意义：高风险：TP53突变和chr20q扩增/ATRX突变的同时存在；中风险：TP53突变、ATRX突变或amp20q的存在；低风险：缺乏这三种变异中的任何一种。纵向测序显示，大多数分子变异是早期克隆事件，在疾病进展过程中持续存在。结论：与传统的临床病理模型相比，基因组风险分层在STLMS中表现出更优越的临床预后预测能力，在ULMS中则相当。