小鼠肝脉管的3D重建通过序列切片SS-OCT成像

我们报告了一种集成框架，用于高分辨率肝组织和血管的3D重建，结合了创新硬件和量身定制的算法管道，以支持肝病的机制研究。定制的系统将扫源光学相干层析成像（SS-OCT）与自动组织切片同步，促进了连续的体积成像。专用软件管道校正成像畸变，通过级联方法对血管进行分割，并应用新颖的径向结构一致性校正（RSCC）算法，以确保大血管描绘的精确性。为了验证该系统，我们在通过所提出的定制设备获取的小鼠肝脏数据集上进行了全面的体积实验。这一方法揭示了肝脏血管树的完整空间组织和分支模式。通过骨架化、密度和直径映射的综合定量分析，提供了血管网络的详细特征。这项工作建立了一种稳健的定量方法，用于重建复杂的血管系统，为研究肝病中的组织和血管变化提供了强大的工具。