人口老龄化和免疫介导疾病日益增加的负担促使人们努力用临床可用的生物标志物量化免疫衰老。免疫衰老时钟是从免疫表型学、转录组学、蛋白组学、表观基因组学和适应性受体库中建立的,但异质的任务定义、测定协议和评估标准限制了可比性和转化性。我们回顾了主要的免疫数据模式,并概述了从队列设计、测定标准化到预处理、特征工程、模型开发、验证和重新校准的端到端工作流程。我们提出了一种任务-模式-模型的分类法,将(i)按时间顺序的年龄时钟,(ii)以结果为锚的风险时钟和(iii)细胞谱系/状态时钟进行区分,同时将大宗血液转录组学(全血或外周血单核细胞)视为可以支持年龄尺度或以结果为锚的任务的分子层模式,具体取决于监督。研究中普遍存在的共同限制包括批次效应、成分混杂、终点不匹配、外部验证稀缺和机制锚定有限。我们最后总结了该领域的优先事项,包括多模态集成、具有数字表型的纵向设计、特定于组织和细胞类型的模型,以及可以与干预措施相关联的基于通路的时钟.
Yu等(Fri,)研究了这个问题。