基于全基因组重新测序的三种双向交配猪群肉类营养成分的全基因组关联研究

猪肉是人类动物蛋白的主要来源，随着生活水平的提高，消费者需求已从数量转向质量。氨基酸和脂肪酸的组成决定了猪肉的营养价值和风味。然而，这些参数变化背后的遗传机制尚未完全阐明。在本研究中，我们量化了来自三种交配猪群的长issimus dorsi肌肉中的17种氨基酸和42种脂肪酸，即约克夏 × 藏猪（YT）、约克夏 × 内江猪（YN）和杜洛克 × 藏猪（DT）。YT和YN猪表现出较高的氨基酸浓度，而DT猪则显示出较高的脂肪酸水平。随后，对73头猪进行全基因组重新测序，鉴定出24,125,658个高质量 SNP，其中146个与脂肪酸性状显著相关，识别出19个候选基因与棕榈酸相关（即 GALNT2、RET、RHOU、PHYHIPL、FAM13C、BICC1 和 TAF5L）、与油酸相关（即 ABCB10、LRP1B、ZNF37A、RHOBTB1、HNRNPF、TMEM26、URB2、FXYD4、PGBD5、LOC110256649 和 LOC110256821）以及与总脂肪酸相关（即 UBE2E2）。功能注释显示，这些候选基因主要参与与脂质代谢、葡萄糖稳态和能量平衡相关的途径。所识别的 SNPs 和候选基因为理解猪肉中脂肪酸成分的遗传结构提供了宝贵的见解，并可能作为通过育种改善肉质的分子靶点。