揭示结直肠肿瘤发生的表观遗传和拓扑机制的多组学方法

转录不仅受转录因子、激活因子和抑制因子的调控，还受到表观遗传层次的动态复杂相互作用的调节，包括染色质的可及性、组蛋白修饰和基因组的三维结构。然而，这些层次对结直肠癌（CCR）的贡献程度尚未得到充分特征化。本博士论文的目标是将基因组的空间拓扑与基因表达及其他组学层次（ATAC-seq和CUT&RUN针对H3K27ac和H3K27me3）结合起来，在健康小鼠结肠类器官和携带结直肠癌患者中最常见的突变（Apc、Trp53、Smad4和Kras）的类器官中进行研究。这一方法旨在提供新的生物学见解，揭示在CCR背景下表观遗传机制如何推动转录调控。