结核分枝杆菌拓扑异构酶 I (MtbTOP1) 对结核病病原体的生存至关重要。目前,关于 MtbTOP1 在负超螺旋 DNA 释放催化过程中动态构象的重大问题仍未得到解决。我们旨在研究控制与酶构象变化相关的跨域重排动态的灵活铰链残基,这种变化使得拓扑异构酶的开合成为可能。我们使用在线服务器 PACKMAN 从 MtbTOP1 晶体结构中预测可能的铰链。预测的区域“PRO506 至 LEU526”位于 D2 和 D4 域的边界,p值 <0.05,因此被研究作为潜在铰链。该区域高保守的 ARG516 与蛋白质环中 DNA 互动。该精氨酸与 D4 域的 GLU207 和 D5 域的 ASP691 维持了跨域相互作用。引入丙氨酸替代后,我们在生化实验中进一步研究了突变拓扑异构酶。结果显示,突变 GLU207 和 ARG516 后 DNA 释放活性显著下降,但未影响 DNA 结合和切割,这与其作为域重排中的铰链残基的作用一致。
Ferdous 等人(周四)研究了这个问题。