线虫病毒是一种简单的RNA病毒，通常与真菌线粒体相关，尽管最近的研究表明它们在植物转录组中也存在。在这项研究中，我们报告了从芋头中使用高通量测序（HTS）识别和分子表征一种新型线虫病毒。对有症状的叶片组织的分析揭示了一种长度为2644个核苷酸的病毒基因组，编码一个单一的开放阅读框（ORF），用于RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp），该RdRp由544个氨基酸组成。该病毒序列暂定命名为芋头相关线虫病毒2（CeaMV2），与已知线虫病毒的氨基酸同源性为60.76%，支持其作为新物种的分类（归入线虫病毒科Mitoviridae）。系统发育分析表明，CeaMV2聚集在线虫病毒科，和其他植物相关的线虫病毒分为一类，进一步支持其归入线虫病毒科。保守域搜索确认了特定于线虫病毒的RdRp域（Pfam: PF05919）的存在。RT-PCR和桑格测序进一步验证了CeaMV2在芋头叶样本中的存在。相对较短的RdRp及其在植物转录组中的表达提示可能与植物线粒体相关。此外，计算机分析识别出几种植物源成熟miRNA，如sbi-miR6231-3p，与CeaMV2的RdRp基因具有高结合亲和力，提示RNA干扰可能在宿主-病毒相互作用中起潜在作用。这一发现扩展了已知的线虫病毒多样性，并突显了高通量测序在揭示隐蔽病毒感染和潜在RNAi防御机制方面的实用性。
Bhardwaj等（周四）研究了这个问题。