通过分子对接和动力学探索天然生物碱作为DENV2包膜蛋白的潜在抑制剂

摘要 登革病毒（DENV）是全球范围内影响人类生活的主要蚊媒病毒疾病。每年全球报告20000例死亡，但尚未有FDA批准的抗病毒药物用于治疗DENV感染。DENV的包膜（E）蛋白在病毒与宿主细胞膜的初始结合中起重要作用，使其成为抗病毒药物开发的重要靶点。本研究采用分子对接方法对100种天然生物碱进行虚拟筛选，以对抗DENV2 E蛋白。前十个复合物经过ADMET分析，显示出可接受的药代动力学特性且没有相关毒性。根据对接评分、结合相互作用和药代动力学特征，选择四种化合物进行密度泛函理论（DFT）研究和分子动力学（MD）模拟，即ergosin、奎宁、喜树碱和chelianthifoline。MD模拟分析显示所选复合物在200 ns模拟期间保持稳定。模拟后MM-GBSA分析进一步确认了配体在DENV2 E蛋白活性位点腔内的稳定性，其反映为更高的负结合游离能。这些体内外结果表明，确定的天然生物碱是DENV2 E蛋白抑制剂的有前景候选者，并可能为未来的治疗研究提供基础。