摘要 EGFR-SEPTIN14融合是一种罕见但临床上具有重要意义的致癌事件，发生在大约3-4%的胶质母细胞瘤（GBM）病例中。该融合保留了EGFR的酪氨酸激酶结构域，与SEPTIN14的卷曲-线圈结构域相结合，但由于SEPTIN14在睾丸外的表达极少，通常无法通过RNA测序（RNA-seq）检测到。为克服这一限制，我们开发了一种新检测方法，利用映射到EGFR的软剪接读取，并与SEPTIN14序列完全匹配，从而实现即使在缺乏SEPTIN14转录本读取的情况下也能检测到该融合。使用该方法，我们在阳性对照、具有DNA证据的样本以及SNUH队列中发现了额外的之前未检测到的病例。这些GBM样本表现出特征性致癌突变谱，包括TERT启动子突变、EGFR扩增和CDKN2A/B缺失，这些可能间接作为指示融合存在的标记。值得注意的是，一名采用厄洛替尼治疗的融合阳性患者显示出部分反应，暗示对EGFR酪氨酸激酶抑制剂的潜在敏感性。我们的方法在TCGA-GBM数据集中的应用也识别出了具有类似突变谱的新阳性样本，证明了其对全转录组数据的可扩展性。总体而言，我们的策略使EGFR-SEPTIN14融合的检测灵敏度提高了66.7%，解决了当前RNA-seq融合检测工具的一个关键限制，并支持将EGFR-SEPTIN14融合认定为实体肿瘤中的一种可操作的致癌驱动因子。引文格式：Suhyun Hwangbo, Sungyoung Lee。克服低SEPTIN14表达以检测RNA测序中的EGFR-SEPTIN14融合摘要。在：美国癌症研究协会年会2026的会议记录；第一部分（常规摘要）；2026年4月17-22日；加利福尼亚州圣地亚哥。费城（宾夕法尼亚州）：AACR；癌症研究2026；86(7 Suppl):摘要编号5926。
Hwangbo等人（周五）研究了这个问题。