饲料中抗生素对猪肠道微生物组的影响

抗生素已在农业动物中用于治疗疾病、预防疾病和促进生长超过50年。关于这种抗生素使用对人类疾病治疗的影响存在激烈的争论。我们在高度控制的环境中饲养猪，只对一部分同窝猪施用含有增效抗生素氯四环素、磺胺嘧啶和青霉素的饲料（称为ASP250），而另一部分则给予相同但不含抗生素的饲料。我们使用系统发育、宏基因组和定量PCR等方法来研究抗生素对猪肠道微生物群的影响。经过14天的抗生素治疗，细菌分类群发生转变，接受治疗的猪在同一时间点与未接受治疗的猪相比，变形菌门Proteobacteria的比例增加了1-11%。这种变化是由大肠杆菌群体的增加驱动的。宏基因组分析显示，与能量产生和转化相关的微生物功能基因在饲喂抗生素的猪中增加。此外，结果还表明，在接受治疗的猪微生物组中，抗生素耐药基因的丰度和多样性增加，尽管未接受治疗的猪已有较高的耐药基因背景。一些富集的基因，如氨基糖苷氧磷转移酶，赋予抗生素耐药性，而这些抗生素在本研究中并未使用，显示出对未饲喂抗生素类别的耐药性间接选择的潜力。对农业动物饲喂亚治疗剂量抗生素的间接影响是显而易见的，必须在成本效益分析中加以考虑。