通过RNA聚合酶II延伸的转录增强子对替代剪接的调控

启动子和增强子是顺式作用元件，通过复杂的蛋白-DNA和蛋白-蛋白相互作用网络控制基因转录。启动子负责放置RNA聚合酶，而增强子和启动子可以控制转录的启动和延伸。我们之前已经证明启动子结构调节替代剪接，加强了转录与剪接之间在物理和功能上的耦合概念。在这里我们报告，启动子效应是由于对RNA聚合酶II延伸的控制。我们发现猿猴病毒40（SV40）转录增强子插入的纤维连接蛋白（FN）迷你基因构建体转染到哺乳动物细胞中，控制替代剪接，通过抑制FN额外域I（EDI）外显子包含在成熟mRNA中。增强子子域的缺失分析和体内与特定增强子DNA亚片段的竞争显示，“最小”增强子由两组72-bp重复序列组成，负责剪接效应。72-bp重复区域已被报道促进RNA聚合酶II延伸。当转录由与SV40增强子连接的α-珠蛋白启动子驱动时，基础EDI包含量和SR（富含丝氨酸-精氨酸）蛋白SF2/ASF的激活远低于其他启动子。仅删除其中一个72-bp重复不仅诱发更高的EDI包含水平，还允许对SF2/ASF的响应。这些效应是RNA聚合酶II延伸减少的结果，既通过短的近端转录本相对于全长转录本的比例增加，以及通过染色质免疫沉淀检测到的位于替代外显子上游的更高的聚合酶II密度得以证明。