来自捷克医院的肠杆菌科细菌中OXA/NDM编码特征的遗传多样性

本研究的目的是对四种来自有旅行史和/或在国外住院的捷克患者的共产生NDM和OXA-48样碳青霉烯酶的肠杆菌科细菌进行表征。肺炎克雷伯菌菌株属于“高风险”克隆ST147、ST11和ST15，而大肠杆菌菌株被分配为ST167。所有菌株对大多数β-内酰胺类药物（包括碳青霉烯类药物）表现出耐药性，但对粘菌素仍然敏感。此外，WGS数据分析显示，所有四个菌株共同产生不同组合的OXA-48和NDM型碳青霉烯酶（Kpn47733：bla NDM-5 + bla OXA-181；Kpn50595：bla NDM-1 + bla OXA-181；Kpn51015：bla NDM-1 + bla OXA-244；Eco52418：bla NDM-5 + bla OXA-244）。在Kpn51015中，bla OXA-244位于质粒p51015OXA-244上，而相应的基因则位于大肠杆菌Eco52418的染色体contig中。另一方面，bla OXA-181在Kpn47733菌株的ColKP3质粒上被鉴定，而在Kpn50595中鉴定出承载bla OXA-181的质粒为IncX3-ColKP3的融合体。bla NDM-1基因出现在两个不同的质粒上，p51015NDM-1属于一个新的IncH质粒群，而p51015NDM-1是一个IncF K1-FIB复制子。此外，bla NDM-5存在于两个IncFII质粒中，这两个质粒之间的核苷酸相似性有限。在这两个质粒中，bla NDM-5的遗传环境是一致的。最后，在所有四个产生碳青霉烯酶的菌株中，鉴定出多种额外的复制子，其中一些与重要的耐药决定因素相关，如bla CTX-M-15、arr-2和ermB。总之，本研究报告了首次在捷克医院分离出产生OXA-244的肠杆菌科细菌。此外，我们的研究结果表明了在获取和传播编码OXA/NDM碳青霉烯酶决定因素方面的遗传多样性。