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蛋白质序列中的低复杂性区域(LCRs)与通常观察到的序列多样性相比,其氨基酸组成的多样性较低。最近的研究表明,LCRs 可能与内在无序区域共存,在许多生物中高度保守,并且通常在蛋白质功能和疾病中发挥重要作用。在过去的几十年中,已经开发了几种方法来识别具有 LCRs 或氨基酸偏倚的区域,但大多数作为独立应用程序,目前还没有网络工具允许用户探索蛋白质序列中的 LCRs,并提供额外的功能注释。我们旨在填补这一空白,提供 PlaToLoCo - 低复杂性工具平台的元服务器,该平台集成并收集五种不同的最先进工具的输出,以发现 LCRs,并提供功能性注释,例如域检测、跨膜片段预测和氨基酸频率计算。此外,还可以获得查询序列搜索结果的并集或交集。通过开发 PlaToLoCo 元服务器,我们为社区提供了一个快速、易于访问的工具,用于分析 LCRs,并包含额外信息以帮助结果的解释。PlaToLoCo 平台可在:http://platoloco.aei.polsl.pl/ 访问。
Jarnot 等(Sat,)研究了这个问题。