球状蛋白中的聚(L-脯氨酸)II螺旋：识别与圆二色性分析

提出了一种识别球状蛋白晶体结构中聚(L-脯氨酸)型（PII）构象的方法。在球状蛋白结构中识别出短段PII结构，这些结构占据了未被分配给α-螺旋、β-折叠和β-回转的残基的一大部分。结合Kabsch和Sander方法（1983）Biopolymers 22, 2577识别的α-螺旋、β-折叠、β-回转、PII和无序部分的比例被纳入蛋白质圆二色性（CD）光谱分析中。从未分配给α-螺旋或β-折叠或回转的残基中分离出PII部分，得到了独特的PII CD光谱以及对应未分配结构的不同寻常的CD光谱。从蛋白质CD光谱中预测PII部分的质量与β-折叠和回转的质量相当。