除了端粒附着蛋白之外的克隆特异性染色体重排和蜱虫样酵母菌在亚洲产生的

蜱虫样酵母菌是一种新兴的真菌病原体，因其全球传播、引发与医疗相关的暴发以及抗真菌药物耐药性而日益受到关注。基因组分析显示，早期同时发现的C. auris病例在地理上被分为四个主要克隆。尽管克隆I、III和IV仍在导致侵袭性和多药耐药性感染的暴发，克隆II（亦称为东亚克隆）主要包含耳感染病例，通常对所有抗真菌药物敏感，并未与暴发相关。本文中，我们生成了十二个分离株的染色体水平组装，代表这四个克隆的系统发育范围以及迄今为止描述的唯一克隆V分离株。这个克隆V基因组与克隆I、III和IV高度同源，尽管其序列与其他克隆高度不同。克隆II基因组似乎高度重排，重排发生在GC贫乏区域附近，并在大多数染色体中有大的端粒缺失，导致显著不同的核型。克隆II分离株之间的重排和缺失长度各不相同，包括来自单一患者的两个样本，支持基因组不稳定性持续存在。被删除的端粒区域富含Hyr/Iff样细胞表面蛋白、新型候选细胞壁蛋白和ALS样粘附蛋白。这些家族及其他与药物相关的基因在克隆I、III和IV中显示出克隆特异性的选择特征。关于负责导致侵袭性感染的全球暴发的克隆的端粒动态和细胞表面蛋白的保守性，为克隆之间观察到的不同表型提供了一个解释。