临床克雷伯氏肺炎杆菌株及其外膜囊泡的比较蛋白组学谱分析

摘要 克雷伯氏肺炎杆菌（K. pneumoniae）因碳青霉烯耐药性与超毒性并存而成为全球威胁。外膜囊泡（OMVs）在细菌致病性中发挥重要作用，但其与菌株的功能协调仍不明确。在此，我们对六个代表性克雷伯氏肺炎杆菌群体的比较蛋白组学进行分析，涵盖四种主要表型，包括以ST11-K47和ST11-K64为代表的碳青霉烯耐药超毒性（CR-hvKP）、以ST23-K1和ST65-K2为代表的碳青霉烯敏感超毒性（CS-hvKP）、碳青霉烯耐药经典型（CR-cKP）和碳青霉烯敏感经典型（CS-cKP）。加权共表达网络分析、通路富集和蛋白-蛋白相互作用分析的整合显示菌株与OMVs之间有明显的蛋白组学组织和功能特征。CR-hvKP菌株表现出较高的耐药性和DNA修复蛋白的细胞表达。CS-hvKP（ST23-K1）在菌株中显示出提高的荚膜生物合成蛋白，而CS-hvKP（ST65-K2）菌株则将双组分系统蛋白包装进OMVs。模块保留和相关性分析表明细胞和OMV蛋白组之间的保留有限且相关性较弱，这表明OMV蛋白的组织与细胞蛋白组有明显不同。我们的研究结果突显了OMVs的特殊角色，为克雷伯氏肺炎杆菌的致病机制和潜在治疗靶点提供了新的见解。