多聚糖体肌病2型(PGBM2;OMIM #616199)是一种常染色体隐性肌病,由GYG1中双等位基因变异引起,该基因编码糖原蛋白-1。其特征为进行性肌肉无力和肌肉活检中PAS阳性、耐淀粉酶的多聚糖包涵物。我们报告了一例64岁女性,从50岁初期开始出现进行性近端无力,肌肉组织病理学发现了多聚糖体。基因组测序(GS)检测到一个异合子致病性剪接位点变异,NM₀04130.4(GYG1):c. 143+3G>C。考虑到PGBM2的强烈组织病理证据,GS数据经过重新分析,发现了一个额外的稀有深内含子变异,NM₀04130.4(GYG1):c. 7+992T>G,预测会激活一个隐含外显子。RNA测序(RNA-seq)确认了来自两个变异的异常剪接,显示与c. 143+3G>C相关的外显子2跳跃和由c. 7+992T>G引起的隐含外显子包含。由于缺乏父本DNA,变异相位的确定面临诊断挑战,长链PCR结果不确定。长读GS明确表明这两个变异处于反向,建立了复合杂合性并确认了分子诊断。这些发现使深内含子变异被重新分类为可能的致病性。该案例强调了传统相位方法在成人发病隐性疾病中的诊断局限性,并展示了整合基因组重新分析、RNA-seq和长读GS以解决复杂相位挑战的临床实用性。
Panwar等(周四)研究了这个问题。