单核细胞谱系扩展驱动基因相同的犰狳四胞胎的转录组个体特异性

摘要 基因多样性塑造表型，但即使是基因相同的个体也存在差异。在九带犰狳（Dasypus novemcinctus）四胞胎中，我们之前显示等位基因特异性表达（ASE）不平衡提供了个体性的稳定分子指纹。在此，我们测试这种转录组个体特异性是否反映功能生物学差异。我们对处于三个时间点的五组基因相同的四胞胎的全血RNA进行了分析，发现持续的基因表达特征可以预测个体身份。我们在一个变异性较大的群体中进行了单细胞RNA-seq和ATAC-seq。在这一窝中，最稳定的个体展示了扩展的单核细胞谱系部分和富含炎症及分化通路的基因表达程序。这些细胞类型和调控差异在时间上是稳定的，并且对实验性麻风感染具有稳健性。我们的结果将转录组个体特异性与免疫细胞组成的持久差异联系起来，说明早期的随机事件如何导致在基因相同个体之间产生持久且具有生物学意义的分歧。简要介绍 基因相同的犰狳四胞胎可以通过细胞组成变异塑造的转录组特征进行识别。