B69-13 CRISPR辅助纳米液滴差异识别（CANDI）用于多重分枝杆菌检测

摘要 快速准确地识别细菌病原体仍然是一个主要的临床挑战，特别是在区分密切相关的物种和解决多种微生物感染方面。在这里，我们提出了CRISPR辅助纳米液滴差异识别（CANDI），这是一种高通量平台，将无物种偏向的靶向扩增与物种特异性的Cas12a检测结合在荧光条形码纳米液滴中。利用保守的16S/23S rRNA位点，我们设计了引导RNA，使得能够区分15种临床相关的非结核分枝杆菌（NTM）物种及亚种。CANDI达到了每次反应10拷贝的灵敏度，解决了混合感染中的少数株，并使用合理设计的引导RNA区分了M. abscessus亚种。应用于300个来源于患者的样本（L-J培养物、MGIT上清液和痰），该平台在4小时内提供了95%的准确性。这些结果确立了CANDI作为一种快速、可扩展和临床验证的NTM及其他挑战性病原体的诊断技术。这一摘要得到了以下资助：NIH