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模型质量估计是蛋白质结构预测的重要组成部分，因为最终模型的准确性决定了其在具体应用中的有效性。通常，在蛋白质结构预测过程中，会生成一组可选模型，从中需选择出最准确的模型。QMEAN服务器提供了两个在社区范围内的盲测实验CASP第八轮成功测试的评分函数。用户可以在复合评分函数QMEAN和基于聚类的评分函数QMEANclust之间进行选择，前者基于单个模型的几何分析得出质量估计，后者基于用户提供的模型集的加权全对全比较计算全局和局部质量估计。该网页服务器对输入模型进行排名，并突出显示每个模型可能存在的问题区域。QMEAN服务器可在http://swissmodel.expasy.org/qmean访问.
Benkert等人（星期五）研究了这个问题。