发育信号网络由多个组件组成,这些组件在胚胎中的相互作用很难量化。几何推理枚举了一组离散的表型模型层次,具有几个复合变量,其参数可以通过体内数据定义。线虫(Caenorhabditis elegans)中的阴道发育是两个信号通路整合的经典模型;EGF诱导和通过Notch的侧向信号传递。已有数据表明在不同遗传背景下三种可能的终末细胞类型的相对概率,以及诱导信号的定时消融,支持一个几何模型,并足以拟合其大部分参数。该模型是完全动态的,涵盖了信号传导和承诺。它预测任何两个背景/条件之间交叉的相关细胞命运概率。这两个信号通路是相加结合的,没有相互作用,而表观遗传作用仅源于几何模型定义的景观中的非线性动态流。通过这种方式,该模型定量拟合了声称显示相互通路抑制的遗传实验。该模型量化了在信号缺失表型中突变表型渗透率中外源与内源噪声的贡献,并在没有额外参数的情况下解释了可用的实验。锚细胞消融的数据固定了定义Notch自分泌信号所需的参数.
Corson等人(星期二)研究了这个问题。