细菌运动的综合遗传特征分析

我们开发了一个强大的实验框架，结合了竞争选择和基于微阵列的遗传足迹分析，以全面揭示细菌行为的遗传基础。将该方法应用于大肠杆菌运动，识别出95%的已知鞭毛和趋化基因，并揭示出三十多个新的基因位点，这些基因在不同程度上通过多种机制影响运动。为了探讨这些基因的网络背景，我们开发了一种方法，通过对双突变表型进行综合分析，揭示全基因组范围内的表观遗传相互作用。这使我们能够将新基因置于信号和调控网络的背景中，包括Rcs磷酸传递路径和环状di-GMP第二信使系统。这个统一框架能够对微生物生物圈中复杂行为的敏感和全面的遗传特征进行描述。