BioMoby 扩展至 Taverna 工作流管理和执行软件

背景：随着生物学日益成为一门计算科学，开发支持生物信息学家和实验生物学家的软件工具，对于探索来自国际基因组、蛋白组和系统生物学项目的庞大复杂数据集至关重要。BioMoby 互操作性系统的创建旨在促进数据从一个基于网络的资源移动到另一个，以满足非专家生物信息学家的需求。在 BioMoby 的开发过程中，欧洲 myGrid 项目正在设计 Taverna，一个生物信息学工作流设计和执行工具。在这里，我们描述了这两个项目的结合形式，即一个 Taverna 插件，通过 Taverna 界面提供对 BioMoby 多个功能的访问。结果：暴露的 BioMoby 功能有助于设计“合理”的 BioMoby 工作流，帮助将 BioMoby 和非 BioMoby 资源进行管道连接，并确保最终用户只需对 BioMoby 及 Taverna 界面有最基本的理解。用户通过对 Moby Central 注册表的插件调用，引导构建语法和语义正确的工作流。Moby Central 提供仅能操作在工作流中给定位置存在的数据类型的 BioMoby 服务菜单。此外，该插件会自动且正确地将所选服务连接到工作流中，从而使用户无需理解任何服务的输入或输出的性质，专注于他们所构建的工作流的生物学意义，而不是服务如何互操作的技术细节。结论：凭借 BioMoby 插件的可用性，我们认为基于 BioMoby 的 Web 服务现在对实验科学家更为有用和可访问，相比传统的 Web 服务更具优势。