自交系数下降的测量：全球化、城市化及其对医学遗传学的影响

本研究探讨了人口因素对人类遗传亚结构的影响。在我们的发现队列中，我们显示了与人口变化的年龄相关的自交系数下降的显著人口趋势。自交系数，亲缘关系的基因组标志，在全基因组层面上可通过延长的纯合区段识别。我们在一组代表性的809名非相关欧洲裔北美人中，识别出平均28.6个长度超过1 Mb的延长纯合区段，这些个体的年龄范围从19到99岁。这些纯合区段占据了基因组的平均42 Mb，对应于整个基因组的1.6%，每个纯合区段的平均长度为1.5 Mb。随着时间的推移，纯合区段的大小和频率逐渐减小（线性回归，p<0.05）。我们还计算了近交系数，并显示出在连锁不平衡之外的全人群杂合度显著上升的趋势。我们成功地在一个人口统计学相似的队列中重复了这些关联，该队列包括477名巴尔的摩老龄研究的参与者。我们还构建了统计模型，显示了20世纪自交系数下降的预测速率。这些预测模型表明，纯合区段的频率将下降14.0%，基因组中纯合区段的比例将下降24.3%，以及基于连锁修剪近交系数的过度纯合度将下降30.5%。由于泛交配和更大的有效种群规模，自交系数的下降趋势可能会影响未来罕见隐性遗传病的频率。自交系数已经下降，看来这一趋势将继续保持。