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单细胞基因表达数据可以提供细胞间通信的见解，使我们能够理解癌细胞与微环境细胞之间的相互作用。我们的目标是揭示细胞间通信如何影响卵巢肿瘤微环境中的终末耗竭CD8 + T细胞。我们处理和整合了卵巢癌scRNA-Seq样本，并根据已建立的经典标记基因的表达模式划分出不同的细胞群体。我们对CD8 + T细胞进行了伪时间轨迹分析，并分析了卵巢癌细胞与终末耗竭CD8 + T细胞之间的通信。调查细胞谱系并推断伪时间揭示了CD8 + T细胞从类 naïve 状态过渡到六种不同的最终状态，其中中央记忆（35%）、效应记忆（31%）和终末耗竭（25%）CD8 + T细胞是最丰富的亚型。细胞间通信分析确定了HMGB1-HAVCR2配体-受体对，介导卵巢癌细胞与终末耗竭CD8 + T细胞之间的通信。高移动性组蛋白盒1 (HMGB1) 被确认是卵巢癌细胞中影响终末耗竭CD8 + T细胞IL32表达的关键配体。从HMGB1到IL32的信号通路揭示了NFKB1作为最重要的信号介导物，以及TP53作为最重要的转录调控因子，通过它们HMGB1影响CD8 + T细胞中的IL32表达。在我们的分析中识别的HMGB1-IL32信号通路可以作为新一代辅助疗法的治疗靶点，旨在抑制和干扰肿瘤细胞对微环境的影响，并增强免疫治疗的效果。
Murmu等人（星期六）研究了这个问题。