分子序列数据中连锁不平衡的检测。

对自然种群中遗传变异的序列水平研究通常表明，大多数多态位点在等位基因频率上非常不对称，稀有等位基因在某个位点附近接近固定。当某个位点的稀有等位基因在样本中只有几次出现，例如少于五个代表时，从关联测试中检测位点之间的连锁不平衡变得非常困难。这是即使是最强大的关联测试——费舍尔精确检验的数值特性造成的。在样本中少于五个代表的位点应排除在关联测试之外，但这通常会留下很少的位点对可以进行测试。根据观察到的连锁不平衡的符号得出一个整体连锁不平衡的测试，它可以利用所有数据。研究表明，通过增加测定的序列长度比通过增加样本中基因组的数量（以相同的总工作量）更能提高功效。