机器学习和网络医学方法用于COVID-19的药物重定位

我们提出了两种用于药物再利用的机器学习方法。虽然我们是为COVID-19开发的，但它们与疾病无关。这两种方法是互补的，分别针对SARS-CoV-2和宿主因子。我们第一种方法包含一个矩阵分解算法，用于对广谱抗病毒药物进行排名。我们的第二种方法基于网络医学，使用图核根据药物对在人类相互组中对SARS-CoV-2感染/复制至关重要的子网络所引起的扰动进行排名。我们的实验表明，我们预测的顶级广谱抗病毒药物包括适用于COVID-19患者的同情用药；且我们基于核的方法所获得的排名与实验数据一致。最后，我们介绍了COVID-19重定位探索器（CoREx），这是一个交互式在线工具，用于探索药物与SARS-CoV-2宿主蛋白在生物网络、蛋白功能、药物临床使用和连接图谱背景下的相互作用。CoREx可以免费使用，网址为：https://paccanarolab.org/corex/.