通过比较肝细胞癌与相应非癌性肝脏的基因表达谱，深入了解肝细胞癌发生机制的转录组水平

人类肝细胞癌（HCC）是全球最常见的癌症之一。在这项工作中，我们报告了对乙型肝炎病毒阳性HCC基因表达谱的综合特征，通过从HCC和非癌性肝脏样本生成大量5'-读段表达序列标签（EST）簇（总计11065个），然后应用于包含12393个基因/EST的cDNA微阵列系统，并与公共数据库进行比较。还使用了包含1176个与肿瘤发生相关的已知基因的商业cDNA微阵列进行基因表达谱分析。上述方法的综合数据确定了2253个基因/EST作为具有差异表达的候选基因。一些与肿瘤发生和肝功能/分化相关的基因被选定用于29对HCC/非癌性肝脏样本的进一步半定量反转录PCR分析。许多与细胞周期调控相关的基因，如周期蛋白、周期蛋白依赖激酶和细胞周期负调节因子，在大多数HCC患者中被失调。Wnt-beta-catenin通路和DNA复制酶的异常表达也可能有助于HCC的发病机制。大量与代谢相关的基因的转录水平发生了变化，而其他基因的表达谱变化可能反映了恶性肝细胞的去分化状态，这两者都被视为潜在的诊断价值标记。值得注意的是，HCC中的改变的转录组谱可能与一些染色体区域的扩增或杂合性缺失相关，提供了HCC转录异常的潜在原因之一。