利用酶进化进行计算蛋白质设计

近年来，人们对理解塑造酶进化的物理化学参数产生了极大的兴趣，同时计算酶设计也取得了实质性进展。本文综述了在设计过程中可以利用进化信息的三个方面：（i）使用祖先序列重建（ASR）为酶设计工作生成新的起点；（ii）学习自然界如何利用构象动态进行酶进化，以便在计算机中模拟这一过程；（iii）从较小的片段模块化设计酶，再次模仿自然界似乎创造新的蛋白质折叠的过程。通过具体案例，我们强调了将进化信息纳入酶设计研究的重要性，以继续推动酶设计研究的边界。