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背景:骨肉瘤是最常见的原发性恶性骨肿瘤类型。引言:本研究旨在探索潜在的关键预后基因及其在骨肉瘤中的作用。方法:从 GEO 数据库下载了三个骨肉瘤的微阵列数据集。通过 Limma 包筛选差异表达基因(DEGs)。基于 DAVID、GeneMANIA 和 Metascape 数据库进行了功能富集分析。通过生存分析提升了 DEGs 的预后价值。使用 CIBERSORT 评估22种免疫细胞的浸润丰度,并随后进行免疫细胞与预后相关基因之间的 Pearson 相关分析。对预后相关基因进行了基因集富集分析和药物-基因相互作用预测。结果:在 GSE36001 和 GSE56001 数据集中筛选出8个共同上调的 DEGs 和13个共同下调的 DEGs。富集分析表明这些 DEGs 涉及血小板激活、SMAD 蛋白磷酸化、淋巴细胞/白细胞/T 细胞激活和细胞迁移。生存分析表明 ADAM19 和 TUBB1 的高表达与良好的预后相关。CIBERSORT 算法揭示 CD8 T 细胞、巨噬细胞 M0 和 M2 在骨肉瘤中的浸润水平较高。ADAM19 表达与初始 B 细胞呈正相关,而与活化树突细胞的浸润丰度呈负相关。TUBB1 表达与伽马δ T 细胞呈正相关,而与辅助滤泡 T 细胞的浸润丰度呈负相关。共发现56种药物靶向 TUBB1。结论:ADAM19 和 TUBB1 可能是骨肉瘤中的预后生物标志物。它们的表达与肿瘤浸润免疫细胞相关。TUBB1 是多靶药物,可能是骨肉瘤中的治疗靶点.
Xing et al. (Thu,) 研究了这个问题。
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