评估cDNA微阵列在检测全球mRNA表达变化中的性能

cDNA微阵列是一种具有准确测量全球mRNA表达水平变化潜力的技术方法。我们报告了一个经过优化的cDNA微阵列平台的评估，以生成与使用微阵列作为获取平台填充基因表达数据库这一目标一致的准确、精确和可靠的数据。研究设计包括两次独立评估，使用来自两个不同生产批次的70个阵列，并使用三个人体组织来源作为样本：胎盘、大脑和心脏。整体信号响应在三个数量级上是线性的，任何元素的灵敏度估计为2 pg mRNA。所有未分化元素的差异表达计算变异系数在整个信号范围内为12-14%，并且不随阵列批次或组织来源而变化。差异表达的最小可检测倍数变化为1.4。关于偏差（观察到的与预期的差异表达比），所有未分化元素的准确度低于万分之一。本报告中呈现的结果表明cDNA微阵列技术平台的可重复性能，所使用方法为评估监测全球mRNA表达变化的其他技术提供了一个有用的框架。