C-蕨 (Ceratopteris richardii) 基因组：关于植物基因组进化的见解，首次部分单孢子蕨基因组组装

蕨类植物以其庞大的基因组和众多的染色体而闻名。尽管经过数十年的推测，但蕨类植物广泛基因组背后的过程仍不清楚，这在很大程度上是由于缺乏已测序的单孢子蕨基因组。缺乏这一重要资源不仅阻碍了对导致单孢子蕨基因组异常特征的进化过程的研究，而且也妨碍了对陆生植物基因组进化的综合理解。在此，我们使用模型蕨类物种Ceratopteris richardii来探讨导致单孢子蕨类植物典型的大基因组和高染色体数目进化和维持的过程（例如，基因组倍增、重复元素的扩散）。我们直接比较了跨越绿色植物生命之树的各种物种的重复组成，以及Ceratopteris的短读和长读组装。我们根据基因组和细胞遗传数据及与大型开花植物基因组相似的重复比例，发现了与Ceratopteris进化历史中一次古老的基因组倍增事件一致的证据。这项研究为理解陆生植物的进化基因组学提供了重要的基础，提供了首个单孢子蕨参考基因组，并为理解这些庞大基因组形成背后的过程提供了见解。