瞬态定植微生物促进肠道失调和功能障碍

健康成人肠道微生物群的物种组成倾向于随着时间的推移保持稳定。在不同因素的影响下，肠道微生物组的不稳定性是微生物失调及其对宿主生理影响的主要驱动力。在这里，我们使用来自瑞典纵向队列的宏基因组数据，确定了肠道微生物组的稳定性，并发现了两种不同的微生物物种组；持久定植物种（PCS）和瞬态定植物种（TCS）。我们验证了这一分组的延续性，为同一瑞典队列生成了其他时间点的肠道宏基因组数据。我们评估了不同地理区域内PCS/TCS的存在，并观察到它们是全球保留的特征。为了表征PCS/TCS表型，我们使用粪便样本进行了生物反应器发酵和代谢建模。最后，利用慢性疾病肠道宏基因组和其他多组学数据，我们确定了TCS在微生物失调中的作用，并与宿主生理的异常变化建立了联系.