与日本人群类风湿性关节炎相关的PADI4基因功能单倍型在英国人群中不相关

目的：在后基因组研究时代，基于连锁和关联的策略开始揭示新型复杂疾病基因。采用这种方法，最近确定了肽基精氨酸去亚硝基酶4基因（PADI4）的功能单倍型，作为在日本人群中易感于类风湿性关节炎（RA）的基因。在本研究中，我们调查了PADI4基因中的单核苷酸多态性（SNP）与英国人群RA之间的关联。方法：研究了与4个外显子SNP（padi4₈9*G/A, padi4₉0*T/C, padi4₉2*G/C和padi4₁04*T/C）相关的关联，这些SNP映射到PADI4基因，并定义了之前报告与RA相关的单倍型。使用5'等位基因歧视测定法进行基因分型。采用期望最大化算法生成估计的单倍型，并比较了来自英国（n = 839）的无关白人RA患者和人群对照（n = 481）的SNP和单倍型频率。结果：在英国人群中，这4个SNP的等位基因频率与日本对照人群所报告的类似，但这些都与RA无关。与日本人群相似，英国人群中的SNP定义了2个主要单倍型，但均与RA无关（P = 0.79）。结论：与日本人群RA相关的PADI4易感单倍型在英国人群中与RA无关。涉及去羟基化途径的其他基因仍然是强有力的RA易感基因候选者，需要进一步研究。