蛋白质折叠机制中的统一特征

我们通过实验和模拟比较了一个蛋白质超家族代表性成员的折叠过程，以探讨折叠机制中的共同特征。三螺旋单结构域蛋白质的同源异型结构域（homeodomain）超家族展现出一系列折叠过程，涵盖了从二级和三级结构同时形成（成核-缩合机制）到二级和三级结构相继形成（框架机制）的完整转变。其机制中的统一要素是（去）折叠的过渡态是扩展的且高度类似天然态，而二级和三级相互作用形成的比例和程度各不相同。随着二级结构稳定性的下降，存在从框架机制向成核-缩合机制的转变或滑动。因此，框架机制和成核-缩合机制是潜在共同机制的不同表现形式。