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动机:在DNA序列设计中兼顾生物学和实际应用需求通常会导致极具挑战性的优化问题。目前的软件解决方案大多针对特定问题且难以组合。结果:DNA Chisel是一个易于使用、易于扩展的序列优化框架,允许通过Python脚本或Genbank注释自由定义和组合优化规范。可用性与实现:该框架可作为Web应用程序(https: //cuba. genomefoundry. org/sculptₐₛequence)或开源Python库(代码和文档请参见 https: //github. com/Edinburgh-Genome-Foundry/DNAChisel)获取。补充信息:补充数据可在 Bioinformatics 在线获取。
Zulkower et al. (Wed,) 对这一问题进行了研究。