分析无细胞肿瘤DNA时的考量与质量控制

循环游离肿瘤DNA（ctDNA）是癌症领域一种极具前景的生物标志物。超灵敏技术能够检测低（< 0.1%）突变等位基因频率，这是充分发挥 ctDNA 在癌症诊断中潜力的先决条件。此外，需要仔细优化整个液体活检工作流程，以实现可靠的 ctDNA 分析。在此，我们讨论了血浆中 ctDNA 检测的重要考量因素。我们展示了如何使用简单的定量 PCR 分析轻松评估每个实验步骤，包括检测细胞 DNA 污染和 PCR 抑制。此外，研究还表明 ctDNA 分析性能受到 DNA 片段化和靶序列两者的影响。最后，我们证明了定量 PCR 可用于评估所需的测序深度，并在整个工作流程中监测 DNA 损失。质量控制分析的应用有助于开发稳健且标准化的工作流程，从而促进 ctDNA 分析在临床常规中的应用。