重组人H链铁蛋白中的计算电静力梯度

计算确定铁储存蛋白质铁蛋白的电静力势，使用人H链同聚合物（HuHF），揭示了该蛋白质的新特征。一些电荷密度与先前识别为蛋白质活性位点的区域良好相关。三重通道、假定的铁氧化酶位点和成核位点都显示出预期的负电势值。然而，三重通道的外部入口周围是正电势区域，形成一个定向向内腔体的电静场。这个电静力梯度为进入蛋白质腔体的阳离子提供了指导机制，表明三重通道是进入该蛋白质的主要入口。三重通道内表面上的电静力梯度指明的通路通向铁氧化酶中心、成核中心以及四重通道的内部入口。成核位点的六个谷氨酸残基形成了一个非常负电势的区域，周围是由于两个保守的精氨酸残基（R63）在近距离（4.9 A）存在而产生的小的正电荷中心，这表明电静场也可能在成核过程中发挥作用。四重通道的电静力势的大梯度产生了一个从内部腔体向外的场，指示该通道可能在将阳离子排出蛋白质内部方面发挥作用。因此，四重通道可以在矿化过程中为质子提供一个出口通道，或者在去矿化过程中使铁离开蛋白质腔体。