古多倍体大豆的基因组序列

大豆（Glycine max）是提供种子蛋白质和油脂含量最重要的农作物之一，并且具有通过与土传微生物共生来固定大气中氮素的能力。我们采用全基因组鸟枪法测序策略对其 1.1-gigabase 基因组进行了测序，并将其与物理图谱和高密度遗传图谱整合，构建了染色体水平的草图序列组装。我们预测了 46,430 个蛋白质编码基因，比 Arabidopsis 多 70%，与杨树基因组相似，后者与大豆一样也是古多倍体（palaeopolyploid）。约 78% 的预测基因位于染色体末端，这些区域占基因组的不到一半，但几乎涵盖了所有的遗传重组。基因组重复事件发生在大约 5900 万年前和 1300 万年前，导致高度重复的基因组，其中近 75% 的基因以多拷贝形式存在。这两次重复事件之后伴随着基因的多样化和丢失，以及大量的染色体重排。准确的大豆基因组序列将有助于鉴定许多大豆性状的遗传基础，并加速培育改良的大豆品种。大豆（Glycine max）是一种重要的商品作物，可提供蛋白质和油脂，其与固氮菌的共生关系使其成为轮作系统中极具经济效益的作物。目前其基因组已被测序：它是首个被测序的豆科植物，且基因组大小为 1.1 gigabases，是通过全基因组鸟枪法技术测序的最大植物基因组。大豆有着丰富的遗传演变历史；基因组重复发生于 5900 万年前和 1300 万年前，导致高度重复的基因组，其中近 75% 的基因以多拷贝形式存在。准确的大豆基因组序列有望加速改良大豆品种的培育。大豆是一种重要的农作物，提供种子蛋白和油脂，并通过与土传微生物共生固定大气中的氮。利用全基因组鸟枪法，其 1.1-gigabase 基因组现已被测序，并与物理图谱和高密度遗传图谱整合，构建了染色体水平的草图序列组装。