Ftx 是一种非编码 RNA，可影响 X 染色体失活中心区域内的 Xist 表达和染色质结构

X 染色体失活（XCI）是一个关键的表观遗传过程，涉及多种非编码 RNA（ncRNA），包括 X 染色体失活起始的主调控因子 Xist。Xist 的 5' 侧翼区是一个大型异染色质热点区域，其中包含多个转录单元，包括一个功能未知的基因 Ftx（five prime to Xist）。在本文中，我们描述了小鼠 Ftx 的特征鉴定和功能分析。我们提供的证据表明，Ftx 产生一种保守的功能性长链 ncRNA，并且在其内含子中还容纳有 microRNA（miR）。引人注目的是，Ftx 部分逃逸了 X 染色体失活，并在 X 染色体失活起始时特异性在雌性 ES 细胞中上调，该表达谱与 Xist 的表达谱密切一致。我们构建了 Ftx 缺失 ES 细胞以研究该基因的功能。在这些细胞中，热点区域内仅检测到染色质标记的局部改变，表明 Ftx 不参与该区域异染色质结构的全局维持。然而，Ftx 突变导致 X 染色体失活中心（Xic）内的转录本水平发生广泛改变，尤其是 Xist RNA 水平显著下降，这与 Xist CpG 岛处 DNA 甲基化的增加相关。总的来说，我们的结果表明 Ftx 是 Xist 的正调控因子，并提示 Ftx 是一种参与 XCI 的新型 ncRNA。