中点根植方法的实证测试

外群方法被广泛用于根植系统发育树。然而，准确的根指示在很大程度上依赖于适当外群的可用性。一种替代的根植方法是中点根植（MPR）。在这种情况下，根被设置在两个最发散的操作分类单元之间的中点。尽管中点根植算法已被广泛使用，但该方法在获取正确根方面的效率仍未经过测试。在本研究中，我们实证测试了MPR在为给定系统发育树获取外群根方面的成功率。这是通过消除来自33篇论文的50个选定数据集中的外群，并使用中点方法根植树来实现的。因此，我们能够比较每种方法所检索到的根位置。数据集被分为三类，具有不同的根一致性：具有单一外群分类群的数据集（MPR成功率为54%）、具有多个在根位置上表现出不一致的外群分类群的数据集（成功率为82%），以及具有多个在根位置上一致的外群分类群的数据集（成功率为94%）。有趣的是，外群根越是一致，MPR的成功率似乎就越高。这强烈表明，MPR方法是有价值的，特别是对于缺乏适当外群的情况。